「畢業論文」課程為生命科學系核心專業課程，歷時三學期，旨在培養學生整合知識與應用實作的能力。學生於完成基礎與專業課程後，從大三下學期開始進入各教授研究室，透過參與實際研究計畫，將課堂所學運用於專題探究，深化對生命科學領域的理解，並培養實驗設計、資料分析與問題解決等專業技能。
課程以「研究歷程導向」為核心，學生在教師指導下獨立完成研究專題，培養自主學習與團隊合作能力。於畢業季舉辦之「畢業專題成果發表會」，學生以壁報形式展示研究成果，並進行口頭簡報與交流，展現其研究能力、表達能力與整合思維。
本課程不僅促進學生將理論轉化為實務，更透過公開發表激發學術交流與創新思維，展現本系學生在研究素養與專業實踐上的全面成長，成為銜接未來研究與職涯發展的重要基石。